El Estuario del Río Muni se localiza en la Provincia de Litoral, distrito de Cogo, entre las coordenadas geográficas 1º00'- 1º20 N / 9º30' – 10º00' E. (John E. Fa., 1994)

El área protegida según la Ley Nº 8/1988 no tiene límites fijos; incluye toda la superficie del estuario y la superficie cubierta de manglares, junto con las bocas de los ríos Mandyan, Congue, Mitong, Toche y Mven, hasta 25 km aguas arriba de su desembocadura y una franja de 10 km a la orilla de cada uno de ellos. La Ley Nº 8/1988 establece una superficie de 460 Km², entre los que 370 Km² de habitat terrestre y 90 Km² de habitat acuatico.

El Estuario del Rio Muni se asienta sobre areniscas y pizarras del secundario. Las lomas de Ukongolomunimbe están formadas por rocas metamórficas que sobresalen de un nivel mas bajo ocupado por rocas de Cretácico. Es una cuenca rellena de materiales meso-cenozoicos originados durante la plataforma Atlántica y su posterior evolución como marco pasivo (Martínez-Torres y Riaza, 1996).

El Estuario del Río Muni se encuentra, al igual que el resto de la Región Continental, dentro de la región climática ecuatorial cálido-humeda; regulada por la proximidad al mar, que actúa como moderador de las variaciones de temperatura. La precipitación en la zona debe oscilar entre los 2.000 mm cerca de la costa y los 3.000 mm mas hacia la cabecera de los ríos. Se distinguen cuatro estaciones bien diferenciadas: humeda (septiembre a noviembre), seca (diciembre febrero), segunda humeda (marzo a mayo), segunda seca (junio a agosto).

La vegetación en el Estuario del Muni pertenece a la selva de la Región biafrana con bosque litoral; una buena parte de la superficie terrestre de esta zona está cubierta por manglares. El Estuario del Río Muni pertenece a la zona ecoflorística 8 conforme el inventario forestal exploratorio realizado por el proyecto FAO/PNUD en 1990 (Kometter, 1991); en la que domina las especies: Miam Calpocalyx heitzii, Edjib Santiria trimera, Ebap Strombosia grandifolia, Andok Irvingia gabonensis y Alep Desbordesia glaucescens.

En las llanuras aluviales al borde del Río Muni en la zona del río de aguas salobres se encuentran extensivas áreas de manglares con Rhizophora spp. (Mangle rojo) y Avicennia nitida (Mangle blanco). Los bosques primarios y secundarios dominan, intercalado con fincas indígenas.

El área protegida contiene hábitats de la mayoría de fauna silvestre en la Región Continental. Es el único hábitat del Manatí (Trichechus senegalensis) en Guinea Ecuatorial. Aunque no se han llevado a cabo censos sistemáticos, entrevistas con gente de la zona aseguran que existe una gran abundancia de especies. Mencionaron primates como: Mono perezoso dorado Arctocebus calabarensis, Mono perezoso grande Perodicticus potto, Gálago gigante Galago elegantulus, Gálago de Allén Galago alleni, Mono mangabey de collar Cercocebus torquatus, Jabalí Potamochoerus porcus, Antílope acuático, Tragelaphus scriptus, Civeta de las Palmeras Nandinia binotata, Gineta tigrina Genetta tigrina, Mangosta egipcia Herpestes ichneumon. También hablaron de muchas especies de roedores y aves. En el estuario se encuentran dos especies de Cocodrilos, Crocodylus cataphractus y Osteolaemus tetraspis. También la Tortuga forestal articulada Kinixys sp.

La presión demográfica en la zona no es grande, existe muchas aldeas dentro de los limites del área protegida. La mayoría son pequeños con pocas estructuras de carácter permanente. La zona tiene muchos poblados cuyos habitantes desconocen que viven dentro de un área protegida. Los habitantes del área realizan la mayoría de sus compras en los mercados en el país vecino (Gabón).

A nivel de comunicación, para alcanzar la zona y llegar al centro distrital de Kogo, se sigue la carretera principal de Bata pasando por Mbini hasta la aldea aduanera Acalayong. Desde allí se cruza el estuario en cayucos o fuerabordas hasta el centro distrital de Cogo. Además existe l vía terrestre que enlaza las ciudades de Mbini y Cogo, pasando por el poblado de Mitom (Mbini). Las pésimas vías de acceso han defendido en cierto modo la reserva.

Por lo general las poblaciones viven de la agricultura, caza y pesca de subsistencia y comercial, así como la recolección de productos del bosque. Existen amplias posibilidades de comercializar la producción agrícola para el mercado al Sur de la frontera.

El Estuario del Río Muni fue creado mediante la Ley Nº 8/88, de fecha 31 de diciembre, Reguladora de la Fauna Silvestre, Caza y Areas Protegidas. Desde la creación del área protegida, no se tiene conocimiento de ningún trabajo específico realizado para la conservación de los recursos naturales de la región. Tampoco existe información sobre algún tipo de trabajo de defensa, delimitación o control de la zona reservada.

El áreas protegida de «Estuario del Río Muni», ocupa uno de los lugares prioritarios; pero, hasta la fecha no se ha realizado ninguna actividad de protección o conservación de los recursos de la zona. Se puede alistar algunos elementos importantes para justificar su inclusión en la red nacional de áreas protegidas, tales como la fauna y flora marítima, palustre, fluvial y de estuario. Unico hábitat del manatí en Guinea Ecuatorial. Una evaluación realizada sobre la diversidad biológica de la zona, indica que existe una degradación y su nivel de amenaza son mas o menos considerables.

Como problemas fundamentales, cabe mencionar : la falta de claridad en los límites que establece la Ley y su delimitación física ; así como la no existencia de ningún trabajo específico para la conservación de esta zona y de los recursos naturales de la región.

Una de las acciones prioritarias para la conservación de la zona es delimitación física de la zona, la urgente implementación de actividades que garanticen la protección de los ecosistemas forestales del área.